因此把碇真嗣救醒时，王平无视各国政府反对，让玲原樱带少年出去绕一圈，然后少年终于知道真相，自己的那一枪没有让任何人幸福，只有让上百万人的死亡并绝望。
看着十四年后的新闻，所有人的批判让原本就有自毁冲动的碇真嗣，更加的绝望的同时，也成功在玲原樱引导下成功开解，那就是把罪过归咎给碇源堂，然后决定让碇源堂陪自己一起下地狱。
于是当绫波零再度出现时，碇真嗣又一次的登上初号机。
可是这一次在碇真嗣的呼应下，渚薰被初号机丢出去，而碇真嗣则是杀向碇源堂，不过作为一个老阴b，碇源堂哪是如此简单。
于是他背后出现eva13机，在碇源堂的驾驶下，初号机与十三号机展开交战，两人一口气打入这世界的负宇宙中，而深爱碇真嗣的渚薰也毫不犹豫地进入。
负宇宙类似于所谓里世界，也就是日本神话所言之常世，看见两人打入负宇宙，王平在在外面旁观着，准备当碇源堂杀出来时给予致命一击。
不过非常幸运的是，碇真嗣与碇唯的背叛。
尤其是碇唯也就是初号机的背叛，让碇源堂大受打击。
于是碇真嗣成功的把枪刺入碇源堂的驾驶舱，将碇源堂的一切野望瓦解。
而碇真嗣在碇唯的包围下也陷入美梦沉睡过去，在梦中那是没有任何使徒...
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